ЛАБОРАТОРИЯ № 12
Лаборатория биоинформатики клеточных процессов
и управления движением
Заведующий лабораторией – д.ф.-м.н. Чернавский Алексей Викторович
Тел.: (095) 2
09-42-25, (095) 952-33-03; E-mail: chernav@iitp.ruВедущие ученые лаборатории:
д.б.н. |
Аршавский Ю. И. |
д.б.н. |
Минина С. В. |
д.б.н. |
Божкова В. П. |
д.б.н. |
Панчин Ю. В. |
д.ф.-м.н. |
Дунин-Барковский В. Л. |
д.б.н. |
Хашаев З. Х .-М. |
д.б.н. |
Кедер-Степанова И. А. |
к.б.н. |
Беркинблит M. Б. |
д.б.н. |
Либерман Е. А. |
к.б.н. |
Воронов Д. А. |
д.ф.-м.н. |
Лукашевич И. П . |
к.б.н. |
Самосудова Н. В. |
Направления исследований
Общей темой исследований лаборатории является анализ информационных процессов в клеточных системах и в моторном управлении. Главными направлениями теоретико-экспериментальных работ в этих рамках служат: биология развития (анализ принципов реализации генетической информации в развивающихся системах), нейробиология (нейронная коммуникация и биохимическая модуляция в нервных центрах), моторное управление (изучение геометрии манипулятивного пространства и управление целенаправленными движениями). Также разрабатываются принципы биоинформатики и искусственного интеллекта, включая построение компьютеризированной системы организации экспертного знания.
ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ
Биология развития.
Группой д.б.н. В. П. Божковой изучались механизмы развития, приводящие к возникновению пространственно упорядоченной дифференциации клеток. В дополнение к широко исследуемым в настоящее время принципам генетического программирования развития показано значение для дифференцировки той информации, которая поступает в клетки через межклеточные связи и, в первую очередь, через высокопроницаемые (щелевые) контакты. С помощью генетических мутантов было подтверждено предположение, что локальная специфика проницаемости каналов щелевых контактов у зародышей находится под контролем генов морфогенеза. В этих опытах были использованы мутанты floating head (flh) линии flh b237, полученные через международное сообщество по Генетике и развитию данио от В. Коржа (Сингапурский институт молекулярной биологии). Полученные данные подтверждают гипотезу о связи щелевых контактов с пространственной упорядоченностью клеточной дифференцировки и демонстрируют путь, позволяющий изучать систему регуляции свойств щелевых контактов на генетическом уровне. Кроме того, выявлены стадии развития у зародышей рыб, на которых проявляется активность фосфатидилинозитольной системы.Свойства клеточных мембран играют важную роль в клеточных процессах, в
том числе патологических В предыдущих исследованиях, проведённых к.б.н. И. М. Плонским на белках слияния вируса гриппа (HA) и бакуловируса (GP64), было показано, что характеристики поры в момент её образования определяются не мембранами, а самими белками слияния. Изучаемыми характеристиками поры являлись начальная проводимость, кинетика образования и обратимость. Было установлено, что поры, образуемые различными вирусными белками, отличаются друг от друга. Планируется синтезировать молекулярные химеры – гибридные молекулы, содержащие аминокислотные последовательности HA и GP64 – и установить, какими участками последовательностей определяются те или иные свойства поры. Работа проводится в сотрудничестве с Лабораторией клеточной и молекулярной биологии Национального института здоровья США.Д.б.н. Ю. В. Панчиным было охарактеризовано новое семейство генов белков щелевых контактов, названных Паннексинами. Новые гены клонированы из к-ДНК человека, мыши, морского моллюска клиона и плоского червя планарии. Гены Паннексинов человека и других млекопитающих экспрессированы преимущественно в головном мозге и предполагается, что их мутации связаны с серьезными патологиями нервной системы.
Нейробиология. Нервная система – основа информационного взаимодействия многоклеточных животных – изучалась в лаборатории на нескольких уровнях. Закончена многолетняя серия работ коллектива ученых, руководимого д.б.н. Ю. И. Аршавским, по изучению нейронных механизмов, обеспечивающих ориентацию морского моллюска
Clione limacina по отношению к полю тяжести. Функциональная организация нейронных механизмов позы чрезвычайно сложна у позвоночных. Преимущество Clione в том, что, будучи брюхоногим моллюском с простой нервной системой, он имеет довольно сложное поведение при плавании в трехмерном пространстве. Была обнаружена и изучена иерархическая организация управления пространственной ориентацией. Детально изучен путь сигналов от рецептора гравитации, статоциста. Они идут к центральному ганглию, где возбуждают церебро-педальные интернейроны, контролирующие мотонейроны хвоста и крылышек. Пространственная ориентация достигается при кооперативном взаимодействии хвоста и крылышек. Управляющие нейронные сети совмещают высокую устойчивость по отношению к случайным воздействиям и большую гибкость с адаптацией к меняющимся условиям. Было найдено несколько мод ориентации, которые определялись функциональными перестройками нейронных связей. В зависимости от температуры воды Clione ориентируется головой вверх (в холодной воде) или вниз (в теплой воде) с тем, чтобы двигаться к слоям с подходящей температурой. При соприкосновении головы с посторонним предметом происходит замирание и пассивное опускание головой вниз. Резкая перестройка происходит при охотничьем поведении. Направление изгибов хвоста не постоянно, но меняется случайно во времени, как если бы Clione сканировал окружающее пространство в поисках добычи. Показано, что в этом поведении участвуют ГАМК-эргические механизмы. Исследования проводятся в сотрудничестве с Институтом нейробиологии Университета Пуэрто Рико и Каролинского института Стокгольма.В группе д.б.н. И. А. Кедер-Степановой изучались изменения активности нейронов медуллярных дыхательных ядер в онтогенезе. Активность нейронов регистрировалась в переживающих срезах продолговатого мозга новорожденных мышей (1-10 дней). Получены дополнительные данные, подтверждающие отсутствие синхронизованной эндогенной залповой активности, т.е. в одном и том же срезе встречаются нейроны, в которых периоды возникновения залпов различны. К 7-8 дню залповая активность исчезает, и нейроны дыхательных ядер работают непрерывно с разной и непостоянной частотой возникающих импульсов. В настоящее время для анализа их активности на компьютер подается импульсная активность нейронов и одновременно измеряются величины последовательных межимпульсных интервалов, а также строится график их частотного распределения (программа В. Ольшанского). B таких условиях опыта удается обнаруживать неявные типы периодик.
Анализ нейронных механизмов дыхательного центра продолговатого мозга проводился также д.б.н. В. Л. Дуниным-Барковским. Исследовался возбуждающий драйв дыхательного центра во время парадоксального сна у кошек на фоне искусственного дыхания при вариации газового состава вдыхаемого воздуха. Начато исследование масштабной нейронной модели дыхательного центра.
Центральное место в организации двигательных синергий занимает мозжечок. Его исследование – традиционная тема лаборатории. В частности, многолетнее исследование клеток Пуркинье проводится группой д.б.н. В. Л. Дунина-Барковского. В текущем году продолжена работа по анализу действия лианного волокна на работу клетки Пуркинье. Исследовано влияние нелинейности свойств клетки Пуркинье на работу мозжечкового модуля. Обнаружено, что выравнивание входа на клетке лианного волокна происходит и при нелинейной зависимости выхода клетки Пуркинье от ее входа. Проанализированы длительные записи активности клетки Пуркинье в виде сложных импульсов. Выявлены длительные участки постоянной средней частоты работы сложных импульсов. Исследование ведется совместно с Ростовским институтом нейрокибернетики, Техасским технологическим университетом и Научным центром здоровья Техасского университета (США).
Нейрон-нейронные взаимодействия в молекулярном слое мозжечка лягушки исследовались к.б.н. Н. В. Самосудовой и к.б.н. Н. П. Ларионовой с помощью метода электронной микроскопии и статистической обработки материала. Показано изменение профиля синаптического контакта параллельных волокон зернистых клеток на дендритах клеток Пуркинье в зависимости от условий функционирования нейронов (повышенная концентрация нейромедиаторов: глутамата и оксида азота в сочетании с разными режимами стимуляции параллельных волокон). Наблюдался переход от прямой формы контакта к выгнутой в сторону шипика или бутона. Подобные изменения отражают динамику межнейронных взаимодействий. Работа ведется совместно с Институтом высшей нервной деятельности РАН.
В плане анализа информационных процессов в нервной системе беспозвоночных к.б.н. Ю. М. Бурмистровым проводилось коррелированное изучение вентиляторной активности и поведенческих проявлений у пресноводных раков Procambarus cubensis, многие поколения которых содержались в аквариуме и которые хорошо адаптировались к лабораторным условиям
. Была разработана техника повторных экспериментов, позволяющая проводить анализ модификаций вентиляторной активности, вызванных влиянием центральной нервной системы. Основной полученный результат состоит в замечании, что локомоторная активность (особенно вентиляторная) служит хорошим показателем функционального состояния рака и восприятия им внешней стимуляции. Возможно, что реакции рака на неожиданные стимулы, подобные ориентирующей реакции млекопитающих включают эмоциональный компонент, т.е. индивидуальную оценку ситуации. Исследования проводились совместно с Институтом высшей нервной деятельности РАН и Институтом ядерной физики при физфаке МГУ.Д.б.н. З. Х-М. Хашаев проводил изучение молекулярного механизма действия ряда фармокологических препаратов широкого профиля (нейропептиды, анальгетики, анестезирующие препараты, наркотические и психотропные средства, а также супертоксиканты диоксинового ряда) с точки зрения их влияния на проницаемость биологических мембран. Эти исследования проводятся в сотрудничестве с Институтом экспериментальной и теоретической биофизики РАН (г. Пущино), а также с Институтом биохимической физики РАН
.Моторное управление.
К.б.н. М. Б. Беркинблитом и к.б.н. С. А. Адамовичем изучались точностные движения к запомненным целям у старых людей при их зрительном и кинестетическом предъявлении. В отличие от молодых испытуемых все пожилые испытуемые показывали более высокую точность при кинестетическом предъявлении целей. Можно думать, что пожилым испытуемым труднее сопоставлять координаты цели, которые хранятся в пространственной памяти, с координатами указательного пальца, которые задаются кинестетически. Обнаружены и другие отличия. Проведены опыты на деафферентированном пациенте при предъявлении целей в темной комнате и в условиях структурированного зрительного поля. После запоминания положения цели указывание проводилось с закрытыми глазами. При трехмерных движениях основной источник ошибок у деафферентированного пациента – трудность управления многими суставами и учет силы тяжести. Предъявление цели в светлой комнате не помогает в решении этих проблем и не ведет к снижению ошибок. Также была обнаружена парадоксально более высокая точность движений к запомненной цели при видении только кончика пальца по сравнению с видением всей руки. Для изучения трудностей интеграции зрительной и кинестетической информации у паркинсоников была разработана новая методика, когда человек видит свою руку не в том месте, где она в действительности находится. Это создает конфликт между зрением и проприоцепцией. Были предложены варианты использования этой методики для реабилитации больных с моторными нарушениями. Кроме того, был проведен трехмерный анализ тремора у людей больных паркинсонизмом (для чего разработана специальная методика) и показано, что использование некоторых лекарств (в частности, Pramipexole) уменьшает тремор. Исследования проводятся совместно с лабораторией доктора Познера в Ратгерсовском университете штата Нью-Джерси (США).Исследование роли возвратного торможения в управлении pитмической импульсацией мотонейpонов у человека проводится к.б.н. Л. П. Кудиной и к.б.н. Н. М. Жуковской. Анализировалось влияние фоновой частоты pитмической импульсации мотонейpонов и момента прихода тормозящей посылки в межимпульсном интервале на эффективность возвратного торможения при произвольном сокращении мышцы у человека. Кросскорреляционный анализ импульсных последовательностей пар мотонейpонов и анализ длительности межспайковых интервалов показал, что, в целом, слабо выраженное возвратное торможение было более эффективным при низкой фоновой частоте импульсации и при попадании тормозящей посылки в конец межспайкового интервала. Различий между медленной и быстрой мышцами (соответственно камбаловидной и двуглавой мышцей плеча) не выявлено. Работы проводились в рамках совместных исследований с отделом бионики Института биокибеpнетики и биомедицинской инженерии Польской академии наук.
Принципы биоинформатики. Метод структурной организации информации в областях знаний, связанных с изучением высшей нервной деятельности, и комплексный подход к интерпретации данных обследования детей с задержкой речевого развития, разработанные д.ф.-м.н. И. П. Лукашевич, позволили ей построить нейрофизиологическую классификацию, показать роль правого полушария в развитии речи, памяти и психо-эмоциональной сферы, а также объяснить некоторые патогенетические механизмы нарушения развития речи и поведения у детей. Разработанная с помощью структурного подхода автоматизированная диагностическая система "ЭЭГ-ЭКСПЕРТ" используется на практике в целом ряде научно-исследовательских и медицинских учреждений Москвы. Работы проводятся при участии Института возрастной физиологии РАО и Института коррекционной
педагогики РАО.Анализ принципов информационного взаимодействия на биологическом уровне проведен д.ф.-м.н. А. В. Чернавским совместно с учеными Сектора 1.1 – "Компьютерная логика в информационных процессах".
В группе д.б.н. Е. А. Либермана велась подготовка эксперимента по обнаружению сознательных процессов у насекомых с помощью ускорителей, генерирующих мощный поток нейтрино.
ГРАНТЫ
:ПУБЛИКАЦИИ В
2000 г.Статьи
:В печати
:Тезисы
: